Cell同期發表多篇外泌體與細胞外RNA文章
添加時間:2019-05-20 17:14:54
來源:外泌體資訊網
最新一期的Cell雜志上,同期發表了7篇外泌體與細胞外RNA(exRNA)文章。內容包括外泌體PD-L1、外泌體組成重新評估、exRNA在多種體液/多種細胞外組分中的精細分析等。其中,2篇關于外泌體的Featured Articles,2篇關于exRNA的Resources,perspective、minireview和preview各1篇。
Poggio M, Hu T, Pai CC, Chu B, Belair CD, Chang A, Montabana E, Lang UE, Fu Q, Fong L, Blelloch R. Suppression of Exosomal PD-L1 Induces Systemic Anti-tumor Immunity and Memory. Cell. 2019 Apr 4;177(2):414-427.e13. doi: 10.1016/j.cell.2019.02.016.
該研究發現腫瘤來源的外泌體上的PD-L1參與了腫瘤細胞的免疫治療逃避。重要的是,對于一些PD-L1抗體治療效果不佳的腫瘤類型,通過抑制外泌體PD-L1分泌并同時進行PD-L1抗體治療,能夠實現良好的抗腫瘤免疫治療。
Jeppesen DK, Fenix AM, Franklin JL, Higginbotham JN, Zhang Q, Zimmerman LJ, Liebler DC, Ping J, Liu Q, Evans R, Fissell WH, Patton JG, Rome LH, Burnette DT, Coffey RJ. Reassessment of Exosome Composition. Cell. 2019 Apr 4;177(2):428-445.e18. doi: 10.1016/j.cell.2019.02.029.
該研究根據嚴格的分離方法對外泌體組成進行了重新評估,確定了蛋白質、RNA和DNA在小細胞外囊泡和非囊泡細胞外物質之間的差異分布,并確定小細胞外囊泡不是活躍的DNA釋放載體,annexin A1是經典質膜形成的微泡的一個標志蛋白。
詳細報道見本期頭條。
Pluchino S, Smith JA. Explicating Exosomes: Reclassifying the Rising Stars of Intercellular Communication. Cell. 2019 Apr 4;177(2):225-227. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.020.
這是一篇針對Reassessment of Exosome Composition研究文章的preview。
Murillo OD, Thistlethwaite W, Rozowsky J, Subramanian SL, Lucero R, Shah N, Jackson AR, Srinivasan S, Chung A, Laurent CD, Kitchen RR, Galeev T, Warrell J, Diao JA, Welsh JA, Hanspers K, Riutta A, Burgstaller-Muehlbacher S, Shah RV, Yeri A, Jenkins LM, Ahsen ME, Cordon-Cardo C, Dogra N, Gifford SM, Smith JT, Stolovitzky G, Tewari AK, Wunsch BH, Yadav KK, Danielson KM, Filant J, Moeller C, Nejad P, Paul A, Simonson B, Wong DK, Zhang X, Balaj L, Gandhi R, Sood AK, Alexander RP, Wang L, Wu C, Wong DTW, Galas DJ, Van Keuren-Jensen K, Patel T, Jones JC, Das S, Cheung KH, Pico AR, Su AI, Raffai RL, Laurent LC, Roth ME, Gerstein MB, Milosavljevic A. exRNA Atlas Analysis Reveals Distinct Extracellular RNA Cargo Types and Their Carriers Present across Human Biofluids. Cell. 2019 Apr 4;177(2):463-477.e15. doi: 10.1016/j.cell.2019.02.018.
該報道展示了一份來自五種人類生物體液(血清、血漿、腦脊液、唾液和尿液)的細胞外RNA圖譜,顯示了六種細胞外RNA載體類型,包括囊泡載體和非囊泡載體。
為了開發細胞外RNA (exRNA)介導的細胞間通訊圖譜,NIH細胞外RNA通訊聯盟(Extracellular RNA Communication Consortium)創建了exRNA圖譜資源(https://exrna-atlas.org)。Atlas版本4P1包含來自19項研究的5309個exRNA-seq和exRNA qPCR概要文件,以及一套分析和可視化工具。通過分析,該研究得到了一個包含六種exRNA類型(CT1、CT2、CT3A、CT3B、CT3C、CT4)的模型,每種exRNA類型都可以在多種生物體液(血清、血漿、腦脊液、唾液、尿液)中檢測到。五種exRNA類型與已知的囊泡和非囊泡(脂蛋白和核糖核酸蛋白) exRNA載體有關。
Srinivasan S, Yeri A, Cheah PS, Chung A, Danielson K, De Hoff P, Filant J, Laurent CD, Laurent LD, Magee R, Moeller C, Murthy VL, Nejad P, Paul A, Rigoutsos I, Rodosthenous R, Shah RV, Simonson B, To C1, Wong D, Yan IK, Zhang X, Balaj L, Breakefield XO, Daaboul G, Gandhi R, Lapidus J, Londin E, Patel T, Raffai RL, Sood AK, Alexander RP, Das S, Laurent LC. Small RNA Sequencing across Diverse Biofluids Identifies Optimal Methods for exRNA Isolation. Cell. 2019 Apr 4;177(2):446-462.e16. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.024.
由于缺乏關于細胞外RNA (exRNA)分離方法性能的認識,導致研究的重復性差,阻礙了exRNA領域的進展。通過對5種生物液體中10種exRNA分離方法的系統比較,發現所得到的小RNA-seq圖譜的復雜性和重現性存在顯著差異。每種方法對不同的exRNA載體亞類的相對效率是通過估計細胞外囊泡(EV)-、核糖核蛋白(RNP)-和高密度脂蛋白(HDL)特異性miRNA在每個圖譜中的比例來確定的。開發了一種基于web的交互式應用程序(miRDaR),以幫助研究人員為他們的研究選擇最佳的exRNA分離方法。這些結果將提高可重復性,并促進exRNA生物標志物的進一步發展。
Das S; Extracellular RNA Communication Consortium, Ansel KM, Bitzer M, Breakefield XO, Charest A, Galas DJ, Gerstein MB, Gupta M, Milosavljevic A, McManus MT, Patel T, Raffai RL, Rozowsky J, Roth ME, Saugstad JA, Van Keuren-Jensen K, Weaver AM, Laurent LC. The Extracellular RNA Communication Consortium: Establishing Foundational Knowledge and Technologies for Extracellular RNA Research. Cell. 2019 Apr 4;177(2):231-242. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.023. Review.
這是一篇關于exRNA的perspective。細胞外RNA通訊聯盟(ERCC)的啟動是為了加快細胞外RNA (exRNA)生物學新領域的進展,并確定exRNAs及其載體,包括細胞外小泡(EVs)是否能夠介導細胞間通訊并用于臨床應用。
L?sser C. Mapping Extracellular RNA Sheds Lights on Distinct Carriers. Cell. 2019 Apr 4;177(2):228-230. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.027.
這是一篇關于exRNA的minireview。
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